这让崇祯非常不满意，他决定利用现代的军队制度来对整个明军经营改革，当然最开始就要从京营开始。
按照他的策划，他准备保留兵部和五军都护府的各自权利，将五军都护府改为军部，这是最上层的改革。
下层按照现代军事的职位，总督为司令，提督改为军长，总兵改为师长，参将改为旅长，游击为团长，千总改为营长、百户改为连长，小旗则为班长。
兵力则为一营一千三百人，一团三营3300人，一旅一万人，一师三万人，一些加强师则由兵部特批才行。一军三师九万人，而司令则保留总督的权利，负责一片地区军政的管理。
至于军功章，则还崇祯一开始设立的勋兵制度，保留原来的一级二级三级的三个等级。
而军衔则改为少军士、中军士、上军士，少军尉、中军尉、上军尉、大军尉。少军校、中军校、大军校，少军将、中军将、上军将，大将军。
另外将世袭制、卫所制全部取消，每个卫所改成地方保安团，由原来的5600人改为3300人，卫指挥使改为团长，归地方节制，负责地方上的安保，同时直接归处兵部管理。愿意归入民籍的可直接发放一年年的军饷归入民籍，不愿意的则按归处各边军部队。
崇祯将一切制定好之后，便在第二天早上，在乾清宫直接召见了兵部、五军都护府各位主官员还有三个内阁大臣。
“臣等叩见皇上，吾皇万岁万岁万万岁”
“众位爱卿请起，来人给诸位大人看座”
“谢皇上”
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